Beberapa kerugian yang dapat terjadi saat menggunakan kartu debit antara lain:
1. Rawan kehilangan atau pencurian kartu debit melalui korban skimming atau phishing
2. Potensi penyalahgunaan kartu debit oleh pihak yang tidak bertanggung jawab atau kehilangan kontrol atas transaksi yang di lakukan
3. Biaya administrasi dan transaksi yang mungkin saja terkadang cukup tinggi.
4. Terbatasnya jaringan atau layanan internet yang di perlukan untuk melakukan transaksi menggunakan kartu debit.
5. Terkadang tidak dapat di gunakan untuk transaksi di luar negeri atau memerlukan aktivasi khusus untuk penggunaan internasional.