Beberapa kerugian yang dapat terjadi saat menggunakan e-wallet antara lain:
1. Rawan pencurian perangkat yang di gunakan untuk mengakses e-wallet, atau kebocoran data.
2. Terbatasnya jaringan atau layanan internet yang di perlukan untuk mengakses e-wallet
3. Adanya biaya administrasi atau transaksi yang dapat terkadang cukup tinggi
4. Tidak semua merchant atau pedagang menerima pembayaran melalui e-wallet
5. Ketergantungan pada teknologi yang dapat mengalami gangguan atau kerusakan teknis.